教宗亚历山大六世受到的诽谤是最多的，这些谣言不但出自他的政敌，也出自教廷内部他的政敌的代言人，以致教会的一些史学家也信以为真。新教则更是将其演绎和添油加醋。
在近代历史学上，出现了一股“修正”风，一些写手不再用传统的眼光看一个历史事件，而是颠倒黑白，在很多情况下，这样修改历史不是因为找到了新的证据，而只是为了满足个人的胃口，或者为了迎合部分读者的偏好，或者为了讨好某个审查机构。比如，有些人就故意把教宗比约十二世写成是纳粹的支持者，可事实上他当时保护了无数犹太人，战后犹太人还专门为此表示感激。
教会的一些史学家似乎也开始不认真起来，比如一部教会人士写的、作为德国大学教材的教会史，总喜欢对教宗说三道四，这不禁令人纳闷，这是在写史书呢，还是在写史评呢？也许是为了讨新教学生喜欢吧？还有国内某本教会词典（教会人士写的），竟然对圣若望保禄二世有微词。这本书出版时教宗若望保禄二世在健在，现在他成圣人了，这是不是莫大的讽刺呢？不知是否非得怎么做才能通过审查？
教宗亚历山大六世（原名罗德里戈.波吉亚）于1431年生于西班牙瓦伦西亚的舍蒂瓦。他的父母均出自波吉亚贵族家庭。罗德里戈于1492年被选为教宗，取名亚历山大六世，于1503年驾崩。波吉亚家族不只出了这一位教宗，他母亲的兄弟阿方索于1455被选为教宗，取名嘉礼斯多三世。顺便提一句，罗德里戈的孙侄圣方济各.波吉亚于1510年出生，他是甘迪亚的第四位公爵，后成为耶稣会第三任会长，于1671年封圣。
罗德里戈在四兄弟中排行老二，他很小就被献给教会，十六七岁的时候，很可能是在他舅舅阿方索（当时已是枢机）的支持下，被送到意大利博洛尼亚的一所著名大学学习法律。阿方索枢机被选为教宗后，他被提拔得很快，详见
亚历山大六世重要事件年表：
1431: 生于西班牙瓦伦西亚的舍蒂瓦
1441: 10岁，在瓦伦西亚上学
1446/7: 15-16岁，在罗马
1449: 18岁，在意大利博洛尼亚学习法律
1455: 24岁，舅舅被选为教宗，他被任命为宗座总书记官。
1456: 25岁，被圣为枢机司铎
1456: 26岁，被圣为枢机主教，任命为安科纳（教皇国的一个区）宗座代表。
1457: 27岁，被任命为国务卿
1472-1473: 出任西班牙宗座使节
1477: 出任那不勒斯宗座使节
1492: 61岁，被选为教宗
1503: 72岁，驾崩
那个时代的教宗除了拥有神权外，还有君主的政治权力，教皇国拥有意大利半岛的大片领地。罗德里戈任枢机的时候，意大利的政治环境极为复杂，南部的那不勒斯是教宗的封地，但统治那不勒斯的国王Ferrante拒绝承认教宗的所有权；北部有很多小国，由于害怕大国崛起，他们组成联军，限制威尼斯等大国的扩张，对于教皇国，他们则设法干扰教廷正常工作，使它无法顾及自身的发展，从而以使自己有更多的生存空间；教皇国内的大家族，如Orsini家族和Colonna家族，他们彼此争斗，试图在教皇国控制更大的地盘，他们甚至试图控制教廷。所以那个时代的教宗不得不找自己信任的人在教廷工作，否则就有被人收买的危险。
这些家族无视教皇国的法律，导致社会秩序混乱，谋杀、街头械斗成了家常便饭，盗贼肆虐。
尽管罗德里戈枢机很年轻，但他的能力证明他能应对挑战，他彻底击垮盘踞在罗马的各大家族，使宗座权力重新得以恢复，并实施很多公平、合理的法律。他每周二对我办公，倾听冤情，并用自己的钱帮他们解决困难，责令调查谋杀案。
嘉礼斯多三世驾崩后，他的继任比约二世（意大利人）当然也要用自己信任的人，他调走了所有西班牙人，但唯独留下罗德里戈枢机，继续留任国务卿职务。其它三位教宗对他评价如下：
保禄二世：”罗德里戈国务卿尽管很年轻，但在判断上已经很老成了。”
教宗西克斯图斯四世：“罗德里戈已经任国务卿很多年了，他最杰出，最勤奋。”
教宗英诺森八世在给罗德里戈枢机的信中写道：“有时我们把自己的想法发给你，你以你高尚的天赋以及非凡的美德加以辨别，在我们看来，你是穿着枢机尊严的辉煌，为罗马教会服务。近三十年来，你给我们的前任嘉礼斯多三世、比约二世、保禄二世、西克斯图斯四世和我们自己留下了愉快的记忆。这一次，你帮助我们承担教会责任，肩负重担，持续不变地勤奋工作，用你超凡的审慎、精湛的智力、即时的判断、对你所发誓言的忠信、长期的经验以及我们所看到的你的其它美德，来帮助教会。你对我们真是太有用了。”
如果罗德里戈枢机真的像谣传所说的那样“淫秽、虚伪、自负、虚假、不忠、亵渎、贪婪、无节制的野心、偏爱暴力、比外教的还差”，他早被赶出教廷了。他在教廷的高位上工作了37年，先后服务于四位教宗。
有学者说罗德里戈枢机极其奢侈，但那是在国事访问之类的公共场合，以体现职位的尊严。这些学者应该读到他私下里有多么节俭的历史事实。他的朋友们都避免和他一起吃饭，因为他只吃一道菜。他只喝少量的酒，而且睡的时间很短。
1492年8月11日，枢机们（共23位，其中21人为意大利人）一致同意选罗德里戈枢机为教宗。De Roo蒙席曾访遍欧洲各大图书馆，包括梵蒂冈档案室，查阅了几百份史料和文献，经过调研，他这样评价这次教宗选举：“枢机们一致同意（他当教宗）足以证明他的清白。众多历史学家，包括天主教会的，宣称他仅以2/3票当选或一票（他自己投自己一票）当选，只能说明他们没有做太多的历史研究。”
他当教宗不久，与他同时代的德国史学家Hartman Schedel这样写道：“他和蔼可亲，值得信赖，审慎，虔诚，精通与他职位与尊严相关的所有事务。所以，他确实受到天主的降福，具备那么多美德，拥有如此高的尊严。”
亚历山大六世当选教宗后，曾经支持他的那不勒斯国王Ferrante希望从教皇国获得更多的领地，但均被教宗所阻止，为了让教宗批准他的计划，他想把自己的孙女嫁给教宗的孙侄，但遭到教宗的拒绝。最后，他决定不惜任何代价摆脱他的克星。为了达到这个目的，他给欧洲各君主写了一系列的信，编造说他有各种恶行，尤其编造他靠行贿当上教宗，试图说服他们废黜教宗。
Ferrante国王很快就死了，法国国王查理八世想夺取那不勒斯的王位，他以十字军攻打土耳其人为借口，占领了那不勒斯。教宗拒绝承认查理八世为那不勒斯国王，并且以隆重的仪式给Ferrante的儿子Alfonso加冕为那不勒斯国王，尽管查理八世威胁要在教会内召开大公会议，废黜教宗。
于是，查理八世进军罗马，教宗退守圣天使城堡，不幸的是城堡的一面墙倒塌了，无法防御，他只好派出四位枢机与查理八世谈判，他们是这么说的：“让造谣的人想说什么就说什么吧，现在的亚历山大六世肯定比当选教宗之初更神圣，或者说至少一样神圣。他既不虚伪也不是等闲之辈，他在高位工作了37年，他的言行是有目共睹的，那些今天诋毁他的人，当时是他坚定的支持者，而且他没失掉一张枢机的选票。”
如果是行贿，不可能所有枢机一致同意选他。他被选作教宗时，罗马民众用篝火、火把、花环游行表达他们的喜悦，他们还建造刻有奢华铭文的胜利门以示庆贺，当他在圣伯多禄大堂接受加冕后去圣若望拉特兰堂的路上，人们热烈欢呼并称赞他比他们迎接的任何教宗都伟大。
最终查理八世与教宗达成了协议，他的军队可以通过教皇国，而教宗则赦免所有反叛者。
Orsini家族和Colonna家族在反叛后又重振旗鼓。教宗意识到，要恢复宗座的权力，实施教皇国的法律，必须控制住这两个家族。在接下来的任期里，他始终不遗余力地做着说服工作，甚至不惜动用武力。
教宗亚历山大六世的政治天赋，连他的政敌都承认：“在他内反映出罕见的审慎与成熟的警觉结合在一起，他有超凡的说服力以及在最困难的情况下解决问题的能力。”
这两个家族面对来自教宗的巨大压力，渴望摆脱他。史学家Ferrara陈述道：这是亚历山大六世有坏名声的开始，这些有权势的家族和寄其篱下的诗人发现他们处于危险之中，开始大肆诋毁教宗和他的亲戚，他们靠罪恶掠夺的东西失去越多，诋毁就越强烈。
尽管有所有这些麻烦，教宗亚历山大六世晚年却置身于教会改革，但不是很成功。
1503年夏天，热病在罗马肆虐，亚历山大六世病倒了，驾崩于8月16日。
关于教宗亚历山大六世的私生活，有传闻说他有很多情人，但没有任何事实依据，于是造谣的人又退一步，只说他当枢机时有一个情人，名字叫Vanozza Borgia，与她有五个孩子，四个男孩分别叫Luis-Pedro, Giovanni, Cesar和Jofre，女孩叫Lucretia。但事实与此完全不同，Vanozza嫁给了William Raymond, 亚历山大姐姐Juana的儿子，上面所列的孩子都是他们的后代。William 死于1481年, 之后Vanozza嫁给了Dominic de Arignano。按照当时的习俗，孩子要留在原来的家庭。老大Pedro-Luis已经成年，可以照看家产，老二Giovanni也足够大到可以帮助哥哥。罗德里戈枢机把剩下三个孩子Cesar, Lucretia和Jofre带到罗马，让亲戚Adriana del Mila照顾他们，而罗德里戈枢机则支付他们的生活费。几年后，Vanozza和她丈夫搬到罗马。没有证据显示Vanozza与她第二任丈夫搬到罗马之前曾经造访过罗马，也没记录显示她到罗马后去过教廷。她住在罗马时受到很高的尊敬，1518年去世后，她的墓碑是这样写的：“…她具有杰出的美德，显赫于她的虔诚，加之她的成熟与审慎。”
教宗亚历山大六世常对人说，这些是他的孩子，但造谣者却加以利用，说教宗是这些孩子的父亲。在正式文件中，始终称这些孩子为他的侄子和侄女。教宗在给Lucretia（当时已是费拉拉公爵夫人）的信中称她为主内女儿；在任命Pedro-Luis（当时已是西班牙斐迪南国王）为甘迪亚公爵的的正式文件中，教宗称赞他：“你出自光荣与高贵的父母”。
从时间上看，这些孩子也不可能是教宗的。他们都生于西班牙，Pedro Luis 1460年出生，Giovanni 1474年，Cesar 1476年，Lucretia 1480年，Jofre 1482年。罗德里戈枢机只于1472年-1473年在西班牙出任教廷使节，其它时间没离开过意大利。
曾有一个多明我会士叫Savanarola，呼吁罢免教宗，指控他行贿当教宗，还说：“我确定他不是基督徒，不相信天主的存在。”如果教宗真的有情人和私生子，这必定是他首要指控内容。
Savanarola发现自己的指控并未凑效，进而攻击教宗的政治策略，据史料记载，教宗亚历山大六世从不在意谣言和诽谤，听到后也只是笑笑，但在政治上说三道四，是他不能容忍的，于是他把Savanarola开除教籍。Savanarola宣称，他要从火场中穿过，以证明真理在他这边。令他没想到的是，有位方济会士向他发出挑战，要陪他一起穿火场。第二天，人们聚集在火场，方济会士也到了，可是，Savanarola却躲起来了。群众哗然，世俗政权抓到他，把他烧死了。
除了给教宗亚历山大六世本人造谣外，他的政敌也不放过他的亲戚，对Lucretia的谣言尤其为甚。
Lucretia于1480年生于西班牙瓦伦西亚，1488年与她两个兄弟来到罗马，受到良好的教育，13岁时嫁给Giovanni Sforza，一个领地主。三年后这次婚姻被宣告无效，因为Giovanni无能（根据教会婚姻法，不能生育的婚姻可以无效）。1498年，她嫁给了Alphonso，那不勒斯Frederic国王的侄子。他们深深坠入爱河，在罗马生活得很快乐。Alphonso在教皇国军队中任上尉，但不幸的是，Alphonso于1500年7月被暗杀。1501年她又嫁给Este，费拉拉公爵的儿子。1519年她死于难产，留下了几个孩子。
在她最后一次婚姻前，费拉拉公爵派使节到罗马看看这个未来的儿媳怎么样，使节报告说：“我们发现她非常审慎、周到、友善，性情温和。她优雅、谦逊、可爱、纯洁，是个真诚的、惧怕天主的天主教徒。”
她那个时代的费拉拉地方史学家Gregorovius称她为大众的母亲，因为她聆听、帮助所有受苦的人。在战争引发饥荒，她收入减少的情况下，她典当自己的珠宝，用来帮助穷人。她放弃了从年轻时就习惯的奢华生活，成为费拉拉女子社团的领导者，穿着简单、朴素。
几年后，伟大诗人阿里奥斯托盛赞她的不只是她的美貌、聪慧和虔诚，更是她的爱心，这颗爱心在她去费拉拉之前就已受到赞誉。
她的首任丈夫Giovanni去费拉拉参加了她的葬礼，他在回信中写道：“这里的人谈论她一生中伟大的事，他们说她十年来始终穿着苦衣，最后两年每天办告解，每月领三到四次圣体。”
宗教亚历山大六世所做的贡献还有：
1、第一位宣布玫瑰经大赦的教宗。
2、第一位向美洲派遣传教士的教宗。
3、签署法令，要求梵蒂冈堂区神父和教宗告解神父必须永久地、无一例外地选自圣奥斯定会的高级会士，沿用至今。
4、维护基督徒间的和平，建立欧洲联盟，抵御土耳其人的入侵。
5、为防止西班牙和葡萄牙在新大陆上发生冲突，亲自给他们划了界线。
6、签署法令，建立图书审查制度。
7、重建了罗马大学，聘用了世界上最有名的教授在那里教学，做科学研究，给他们慷慨的待遇。
参考文献：
《你所不知道的波吉亚教宗：亚历山大六世》（What you don’t know about the Borgia Pope: Alexander VI）J. B. Darcy著（注：本文以此书为蓝本）
《教宗亚历山大六世、他的亲戚与他的时代的历史资料》Rt. Rev. Msgr. Peter De Roo蒙席著，五卷，1924年出版。
《波吉亚教宗，亚历山大六世》Orestes Ferrara著，F.J. Sheed、Sheed与Ward英译，1942年出版。
《爱管闲事的会士与任性的教宗》Michael de la Bedoyere著，1958出版。
《最伟大的波吉亚人》Margaret Yeo著，1936出版
《教宗们的生活》Chevalier Artaud de Montor著，Rev. Dr. Neligan英译，1865出版
《改革是如何发生的》Hilaire Belloc著，1928年出版
《教宗们的庆典》John Farrow著，1943年出版
《天主教会的胜利、力量与光荣》H. W. Crocker III著，2001年出版
《教宗亚历山大六世》A.G. Ritchie著
《天主教百科全书》
《教皇制》Paul Johnson著
《天主教会简史》J. Derek Holmes、Bernard W. Bickers著
《罗马与梵蒂冈》Cinzia Valigi著